El sistema MassARRAY de Agena Bioscience™ es una espectrómetro de masas de sobremesa que proporciona un análisis sensible, preciso y rápido de ácidos nucleicos. Con capacidad de rendimiento para satisfacer las necesidades de cualquier volumen de trabajo, rápido a la hora de proporcionar resultados, y con capacidad de interrogar de manera rentable cientos de mutaciones. Descubre aquí los diferentes reactivos de Agena Bioscience.
- Ensayos prediseñados y customizados
- Reactivos iPLEX Pro
- Reactivos iPLEX HS
- Reactivos UltraSEEK
- Reactivos MassCLEAVE
Ensayos prediseñados y customizados
Agena Bioscience ofrece varios ensayos prediseñados y verificados para su uso en el sistema MassARRAY. Sin embargo, disponemos de herramientas para diseñar nuestros propios paneles a la carta.
Crea tu propio panel a la carta con nuestras herramientas
Assay Design Suite es una herramienta simplificada para el diseño de proyectos de genotipado de SNPs, mutaciones somáticas, fusión de genes y biopsia líquida. El software identifica y diseña primers de PCR y de extensión para cada variante de interés. Tan solo necesitamos indicar los números rs, NCBI dbSNP o bien una secuencia de ADN en formato FASTA. Los marcadores compatibles se multiplexan en un único pocillo.
Por otro lado, el software EpiDesigner está indicado para realizar el diseño de análisis de metilación. En una secuencia de ADN dada, el software diseña múltiples primers, para posteriormente ser convertido con bisulfito, con el fin de interrogar múltiples islas de CpG de interés.
Ambas herramientas de software están alojadas en línea en el portal de Agena Bioscience, AgenaCx, y proporcionan: una interfaz fácil de usar para diseñar y modificar paneles.
Reactivos iPLEX Pro
La química contenida en los reactivos iPLEX Pro combina una PCR convencional, extensión y detección mediante espectrometría de masas. Los reactivos iPLEX permiten diseñar ensayos con un nivel de multiplexación de entre 25 a 40 variantes por reacción, lo que proporciona un alto nivel de flexibilidad y un bajo coste por genotipado. La tecnología permite detectar variantes multialélicas y análisis de número de copias (CNV) de forma fácil. Echa un vistazo a nuestra entrada de blog.
Estos reactivos están pensados para ser utilizados en los siguientes escenarios:
- – Genotipado
- – Ensayos de cribado de portadores y enfermedades hereditarias.
- – Validación de biomarcadores
- – Estudios de farmacogenética
- – Análisis de calidad e identificación de muestras
Reactivos iPLEX HS
La química contenida en los reactivos iPLEX High Sensitivity (HS) aumenta la sensibilidad de la reacción iPLEX al restringir el señal del alelo wild type, amplificando así la detección de la variante mutada. Estos reactivos permiten multiplexar hasta 15 mutaciones diferentes por reacción. Los reactivos iPLEX HS permite la detección de variantes alélicas hasta un 1% de límite de detección. Es un método ideal para el diagnóstico utilizando muestras degradadas ya que los amplicones utilizados son cortos (80-120 pb).
Estos reactivos están pensados para ser utilizados en los siguientes escenarios:
- – Detección de variantes de baja frecuencia alélica en tumor sólido.
- – Identificación de biomarcadores oncogénicos utilizando muestras parafinadas.
- – Validación de variantes procedentes de NGS.
- – Cribado de GMO.
Reactivos UltraSEEK
Los reactivos UltraSEEK amplían la sensibilidad del sistema MassARRAY hasta un 0,1% de límite de detección para ser utilizados en biopsia líquida. Esta sensibilidad tan baja se consigue gracias a la extensión de una única base especifica de la forma mutante y a su posterior captura gracias a un sistema de estreptavidina unida a bolas magnéticas. Estos reactivos permiten multiplexar hasta 15 biomarcadores en una única reacción y dado el material de partida permite analizar hasta 100 marcadores.
Estos reactivos son ideales para aquellos investigadores que necesiten:
- – Detectar variantes raras
- – Identificación de mutaciones oncogénicas de resistencia y marcadores de progresión utilizando como material de partida ctDNA, cfDNA y CTCs.
- – Test no-invasivo
Reactivos MassCLEAVE
La química de MassCLEAVE permite analizar el perfil de metilación de forma cuantitativa utilizando el equipo MassARRAY. Detecta fácilmente diferencias en el patrón de metilación de hasta el 5% entre el ADN metilado y no metilado.
Estos reactivos son ideales para:
- – El análisis del perfil de metilación de CpG de entre 150 a 500 pb
- – Analizar el perfil de metilación en muestras parafinadas u otros tipos de muestra
- – Validación de resultados procedentes de Arrays de Metilación, NGS o análisis de promotor
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