Universal Sequencing Technology (UST) fue establecida por un grupo de veteranos en tecnología NGS de Roche/454, dedicados al desarrollo de las tecnologías de secuenciación de ADN más avanzadas y rentables.
Desarrollaron una tecnología, TELL-Seq, para kits de preparación de biblioteca basados en transposasas, lo que permite que las plataformas de secuenciación de Illumina produzcan resultados de muy largo alcance (promedio de 20 kb a 100 kb).
La tecnología permite a un científico hacer una secuenciación de novo (necesidad de investigaciones microbianas, genomas de plantas/animales/insectos, etc.) e identificar variaciones estructurales entre organismos e individuos de manera más eficiente. Los investigadores podrán clasificar los genomas en fases para distinguir los orígenes parentales de las variantes estructurales.
Transposase Enzyme Linked Long-read Sequencing (TELL-Seq™) es una tecnología de biblioteca NGS simple y escalable que genera lecturas vinculadas de códigos de barras para aplicaciones de secuenciación a escala del genoma. Todo el procedimiento se puede llevar a cabo en un tubo de PCR sin necesidad de instrumentación costosa. El kit de preparación de bibliotecas de secuenciación del genoma completo (WGS) TELL-Seq™ generará una biblioteca de secuenciación de Illumina en solo 3 horas. El protocolo se puede ajustar fácilmente en función del tamaño del genoma que se va a analizar. TELL-Seq será el nuevo método de biblioteca estándar para WGS.
Como funciona?
Con el kit de preparación de bibliotecas TELL-Seq™ WGS, puede secuenciar nuevos genomas. Esto funciona para genomas bacterianos pequeños, genomas de insectos, plantas y hongos de tamaño mediano y genomas de animales y plantas grandes. El kit TELL-Seq™ convertirá un secuenciador de ADN ordinario de segunda generación de lectura corta en un secuenciador de ADN de tercera generación de lectura larga.
Las muestras que contienen diversos microorganismos son esenciales para obtener información sobre nuestro ecosistema y las enfermedades humanas. El kit de preparación de bibliotecas TELL-Seq™ WGS le permitirá secuenciar muestras a escala metagenómica; proporcionando resultados similares a los secuenciadores de long-read con la facilidad de la secuenciación de lectura corta.
Los secuenciadores de ADN de lectura corta tienen problemas para identificar variantes estructurales grandes. Estos podrían ser en forma de variantes de número de copia, translocaciones, duplicaciones, eliminaciones, inserciones e inversiones. El kit de preparación de biblioteca TELL-Seq™ WGS vincula lecturas cortas y las convierte en lecturas largas. Los datos vinculados de lectura larga que obtiene con el kit TELL-Seq™ le permitirán dar un paso atrás y ver lo que se estaba perdiendo.
Saber qué cromosoma homólogo tiene qué secuencia es esencial para comprender un genoma. El phasing del genoma completo es difícil de conseguir con la tecnología de secuenciación de ADN de segunda generación. El phasing proporciona información de haplotipos que es importante para comprender rasgos complejos y vínculos de variantes. El kit de preparación de bibliotecas de ADN TELL-Seq™ WGS ayuda con esto, al vincular lecturas cortas a fragmentos más grandes y, por lo tanto, lecturas largas.
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