La aparición de la enfermedad COVID-19 ha dado lugar a la necesidad de desarrollar nuevas estrategias NGS para caracterizar el genoma viral del SARS-CoV-2. La secuenciación del genoma completo es fundamental para identificar variantes con el fin de contribuir a la investigación en los campos de virología, inmunología, epidemiología, entre otros.
Sin embargo, maximizar el número de lecturas de secuenciación de ARN viral a partir de muestras clínicas puede ser un desafío, particularmente debido a la cantidad de antecedentes humanos que pueden estar presentes. En el webinar que encontrarás en la derecha, presentamos una estrategia NGS específica que combina la preparación de la librería Swift RNA Library Prep con el panel Arbor Biosciences myBaits Expert Virus SARS-CoV-2 panel. La combinación de la preparación de la librería de ARN con la captura de hibridación da como resultado una cobertura del genoma de longitud completa a partir de un número limitado de copias del genoma viral en una muestra mixta, lo que maximiza la salida de datos y ofrece un flujo de trabajo ventajoso para la caracterización de virus.
El kit myBaits Expert Virus SARS-CoV-2 panel se basa en todas las secuencias genómicas completas y parciales disponibles en la base de datos NCBI a 31 de enero de 2020. El diseño de las sondas es compatible con el enriquecimiento de moléculas de la biblioteca NGS tanto largas como cortas (incluso de dianas degradadas).
| Feature | Specification |
| Input quantity | 10 ng – 1 µg total RNA into upstream module • 100 pg – 100 ng purified/enriched RNA |
| RNA type supported | Poly(A)-enriched mRNA • Ribodepleted RNA • Total RNA |
| Time | 4.5 hours |
| Components Provided | Fragmentation module • RT module • Library Prep • Polymerase |
| Multiplexing Capability | Up to 768 libraries |
| Category | Product Name | Catalog Number |
| Select an option (REQUIRED) | Swift RNA Library Kit (24 rxns) |
R1024 |
| Swift RNA Library Kit (96 rxns) |
R1096 |
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Indexing Kit is required for complete functionality.
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Unique Dual Indexing Primer Kit (96-plex, 384 rxns, 4 rxns each of 96) |
X90384 |
| Unique Dual Indexing Primer Kit (24-plex, 96 rxns, 4 rxns each of 24) |
X9096 |
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| Set S1-S4 Combinatorial Dual Indexing Primer Kit (768-plex) |
X89768 |
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| Set S4 Combinatorial Dual Indexing Primer Kit (192-plex) |
X88192 |
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| Set S1 Combinatorial Dual Indexing Primer Kit (192-plex) |
X85192 |
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| Combinatorial Dual Indexing Primer Kit (96-plex) |
X8096 |
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| Single Indexing Primer Kit Set A (12-plex) |
X6024 |
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| Swift Unique Dual Indexing Primer Plate (96-plex, 96 reactions) |
X9096-PLATE |
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| Arbor Bio Hyb Capture Reagents | myBaits Expert SARS-CoV-2 Panel 16 Rxn |
308716 |
| myBaits Expert SARS-CoV-2 Panel 48 Rxn |
308748 |
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| myBaits Expert SARS-CoV-2 Panel 96 Rxn |
308796 |
